历经几十年发展，本学科已形成了“学科交叉融合，基础临床共赢”和“理论促进创新，创新驱动发展”的模式，使古老学科在发展中找到了动力，新兴学科在发展中增添了活力，具有下述明显特色和优势：

　　1. 鲜明首医特色的转化医学模式

　　本学科打破基础医学与临床应用之间的屏障，开拓了传统学科与新兴学科的交叉科研领域。以临床问题为中心，增强了传统解剖形态学与功能学的有机融合，加快了病原学与免疫学相互渗透，建立了针对临床问题开展基础研究的多个研究平台及中心，极大发挥了转化医学的作用，强大的基础医学和临床资源为培养创新型医学精英人才创造了条件。

　　2. 突出的学科贡献和社会服务职责

　　我校“国家生命科学与技术人才培养基地”是全国唯一的临床医学人才培养基地，“基础医学”学科作为其重要组成部分，为北京医疗战线输送了占半数以上的医务工作者和科研工作者，涌现了王辰院士、张罗教授等一批杰出医学人才。近5年来，招收博/硕士研究生155人、授予学位147人，更好地满足了北京和国家经济社会发展对高层次医学人才的需求。本学科在诊疗艾滋病、结核病等重要传染病以及处理国家和北京市突发公共卫生事件（甲型H1N1流感、登革热等）中发挥了不可替代的作用，为保障北京市乃至全国人民健康、推进社会发展和维护社会稳定做出重要贡献。

　　3. 强大的学科优势和雄厚的师资力量

　　本学科有博士生导师19名，其中包括北京市教学名师、北京市突出贡献专家、教育部新世纪优秀人才、北京市新世纪百千万人才等，在国内各专业领域具有较高学术影响力。近年引进了多名中青年学术带头人，为学科的可持续发展提供了优质的人力资源。本学科近5年共承担国家自然科学基金等省部级以上课题150余项，总经费11320.513万元。获省部级科研奖励2项。发表SCI论文233篇，获国家发明专利12项，专利成果转化1项。

　　4. 服务于国家重大需求的学科方向

    依托首医基础-临床优势资源，以服务国家重大需求为指导建立了特色鲜明的学科方向。形成了“从宏观到微观、从正常到异常、从发育到调控，从症状到机制”的疾病研究模式，利用学科交叉优势，在重大和重要传染病、肿瘤、心血管疾病、免疫性疾病等的研究中取得了一定的成果，对相关临床学科的发展发挥了有力的推动作用。